Tumorsignaturer korreleret til klinisk respons hos kvinder med brystkræft
Tumorsignaturer kan forudsige den kliniske udvikling af HR-positiv brystkræft, patienternes respons på neoadjuverende kemoterapi samt den sygdomsfri overlevelse for kvinder med terapiresistent brystkræft.
Det konkluderer et nyt tysk studie.
Det tyske studie er publiceret i tidsskriftet Annals of Oncology. Studiet er designet som en retrospektiv analyse, hvor forskerne undersøgte, om de kunne finde sammenhænge i mutationssignaturer og den kliniske udvikling af HR-positive brystkræfttumorer, herunder patienternes respons på kemoterapi og samlede overlevelse.
Til analysen anvendte forskerne en kohorte fra det kliniske studie, GeptaSepto og udførte hel-exom-sekventering på 405 præterapeutiske prøver fra forsøgsdeltagerne. Sekvenserne blev analyseret for tilstedeværelsen af 11 mutationssignaturer, herunder biologiske processer, såsom APOBEC-mutagenese, homolog rekombinationsmangel (HRD), mismatch reparationsmangel (MMR) og aldersrelaterede - eller tobaksinducerede ændringer. Det primære formål var at undersøge mutationssignaturer og mutationsbelastning i tumor for at forudsige respons og resistens over for neoadjuverende terapi, mens de sekundære mål inkluderede undersøgelse af korrelationer mellem mutationssignaturer og flere forskellige klinisk-patologiske parametre. Analysen havde de foruddefinerede endepunkter for patologisk komplet respons (pCR; defineret som fravær af invasiv kræft og in situ kræft i bryst- og aksillære noder [ypT0ypN0]) og sygdomsfri overlevelse (DFS).
Forskerne definerede undergrupper af brystkræft ved forskelle i HRD-relaterede og APOBEC-relaterede mutationssignaturer, signifikante forskelle mellem HR-negative og HR-positive tumorer såvel som ved korrelationer med alder, Ki-67 og immunologiske parametre. Forskerne evaluerede herefter antallet af mutationer i hver signatur og den eksoniske mutationshastighed (EMR; pr. Mb) i HR-positive og HR-negative tumorer.
Signaturer afslører forskelle i respons
Resultaterne fra analysen viste, at der var væsentlige forskelle på tværs af de forskellige tumorsignaturer. Der blev således observeret:
- Et højere antal mutationer i HR-negative tumorer for signatur-3 (S3) (HRD; p <0,001), S13 (APOBEC; p <0,001), S6 (MMR); p = 0,015), S21 (MMR; p = 0,015), S4 (tobak; p <0,001) og i alt (EMR; p <0,001).
- Signifikant højere mutations-tal i HR-positive tumorer for S16 (ukendt proces; p <0,001) og S28 (ukendt proces; p = 0,002).
Som forventet var den samlede pCR-hyppighed af patienter med HR-negative (triple-negative brystkræft) tumorer 38%, hvilket var signifikant højere end 12,7% pCR-frekvensen for patienter med HR-positive tumorer (p <0,001). I HR-positive tumorer blev forskelle i pCR-hastigheden observeret for forskellige mutationssignaturer; de to vigtigste mutationssignaturer var S3 (HRD, p <0,001) og S13 (APOBEC, p = 0,001), som i univariabel analyse var signifikant associeret med en øget pCR-hastighed efter neoadjuverende kemoterapi, ligesom det var tilfældet for den eksoniske mutationshastighed (EMR; p = 0,002).
Negative indikatorer inkluderede signaturerne S3 (HRD; p = 0,006) og S4 (tobak, p = 0,011), som var prognostiske for reduceret DFS hos patienter med kemoterapi-resistente tumorer.
